La géographie militaire remonte à Louis XIII et jusqu'en 1940 son histoire est assez simple.

Les ingénieurs géographes créés en 1696 exercent d'abord au Dépôt de la guerre jusqu'en 1887, puis de 1887 à 1940 au service géographique de l'armée (SGA). Ce dernier est dissout le 27 juin 1940 pour créer l'institut géographique national (IGN).

En 1946 deux organismes militaires (la section géographique de l'armée (SGMA ou SGA) et le groupe géographique autonome) sont créés au coté de l'Institut géographique national qui reprend les missions du service géographique de l'armée) sur le territoire national.

En 1991, après la guerre du Golfe, la géographie devient interarmées avec la création du Centre géographique interarmées.

Aujourd'hui seules 3 unités sont en activité. Leur activité est coordonnée par le bureau géographie, hydrographie, océanographie, météorologie du commandement pour les opérations interarmées.